扫描式 DNA 感应器

品中的标的 DNA 浓度降低时，粉红色即变淡，无法以肉眼觉察（样品莫耳浓度为 10-10、未以银离子显影液处理者）。为了解决这个问题，研究人员发现可加入含有银离子的显影液。因为金纳米粒子可促进银离子与显影液中所含还原剂（氢）之间的反应而生成还原态的银，银的沉积会显出黑色，不但容易辨识，而且可用一般传统的光学扫描仪器侦测。利用所得深浅不同的结果以灰阶加以相互比较，就可区别样品间浓度的高低，甚至能轻易地以肉眼观察，因此大大提升了敏感度。即使当 DNA 序列间的差异只有一个碱基时，都能区分出来。由此扫描式 DNA 感应器所检测的结果显示，在较低温时（摄氏 40 度），除了正确配对的碱基 A 之外，其它三种错误的 G、T、C 碱基对亦可结合。但是当温度提升至摄氏 50 度时，仅有正确的腺嘌呤（A）仍然维持配对状态，其它三种（亦即 G、T、C）的呈色会消失，因此决定选择性的温度是摄氏 50 度。若是温度继续升高至摄氏 60 度，即使是含有正确的腺嘌呤（A）的 DNA 序列也会脱离，而导致呈色完全消失。以荧光为呈色的方法虽也有类似的结果，但是增温范围太小（摄氏 15 度至 35 度），决定专一性结合的温度也较扫描式 DNA 感应器来得低。因此，温度的变化只要高于正确结合的温度摄氏 35 度，就会导致专一性结合的 DNA 序列脱离而使得呈色减弱。此外，由于实验过程中需要反复地以溶液冲洗，当正确序列结合的温度太接近室温时，会使得部分专一性与非专一性结合的 DNA 序列较容易一起被洗掉，因此其呈色普遍性地较为微弱。由于扫描式 DNA 感应器的专一性结合温度较高，就可以避免这种困扰。其敏感度较一般以萤光剂为呈色的方法高 100 倍，而且对于单一碱基错误配对的选择性也高出 3 倍。同时，因为扫描式 DNA 感应器的敏感度较高，对于样品的量要求也就较低，因此优于一般以萤光呈色的 DNA 感应器。以扫描式 DNA 感应器来侦测样品中的 DNA 序列时，样品中的标的 DNA 序列的浓度高低虽然可藉由灰阶来推测，但是其结果仅能以黑白二色呈现，因此每次能检测的种类数目受到较大的限制。以萤光分子为标帜的侦测法中能有颜色上的变化，较受一般检验人员的欢迎，而且若能以彩色呈现，就可以容许在检验样品中一次含有多种待测的 DNA 序列，因此，如何将黑白变为彩色就变成研究人员的下一个目标。
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