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合难以区分。 连锁基因遗传规律在理论上证实了基因位在染色体上，染色体是基因的载体，基因在染色体上呈直线排列，为基因定位奠定了理论基础；基因的连锁和互换，可使有利基因组合在一起和增加变异，因此有利于进化。在育种实践上可加强育种工作的预见性，如果选育的两性状属连锁遗传，且希望通过互换的非等位基因重组来选育新品种，则在相同选择效果的条件下，连锁群体的杂种群体要比独立遗传的大，且互换率越小，要求的杂种群体越大。此外还可提高选择效率，例如，大麦秆锈病一般要到抽穗后才发生，因此在生育前期无法鉴定和选择抗秆锈病植株。 后来发现，抗秆锈病大麦的苗期有一特点——叶片黄绿色。这是黄绿色基因和抗秆锈病基因连锁的结果。这样，在苗期只保留叶片黄绿色的幼苗，就相当于保留抗秆锈病植株。抽穗后，再复查一次，把抗秆锈病和丰产的选出来，这样可大大提高选择效率。
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