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基因的重复倍增在进化过程中是经常发生的。多基因家族是多种基因组中常见的组分。比较多基因家族中的单个成员的序列，有可能发现来源于单个祖基因的基因家族的进化过程中发生的单个基因的重复。这些基因的重复倍增的机制可以有： ①同源染色体不等交换(unequal crossing—over)。这是一对同源染色体之间在各自不同的位置上发生核苷酸序列的重组，其结果是在重组后的一条染色体上出现一定DNA序列的重复。 ②姐妹染色单体不等交换。其发生的机制与同源染色体的不等交换相同，差别的只是涉及单条染色体的一对姐妹染色单体。③DNA扩增。在细菌和一些单倍体生物的DNA复制泡(replication bubble)中，二条子DNA分子之间可能发生不等重组而造成一部分DNA序列或基因的重复。
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