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反转录病毒的DNA插入宿主细胞染色体时,在5’LTR的U3左端和3’端LTR的U5右端各丢失2 bp,而在宿主染色体插入位点上生成4~6 bp的重复序列。反转录病毒的DNA基因组整合在宿主染色体上的位点是随机的。每个受感染的细胞一般有1~10份前病毒拷贝。反转录病毒DNA的整合是复制病毒RNA的必经阶段。只有当受感染细胞处于细胞分裂期间,反转录病毒DNA基因组才能接触到宿主细胞的遗传物质。因此,反转录病毒只能在分裂中的细胞内复制。 LTR对病毒DNA整合进宿主细胞基因组和控制病毒RNA合成均有重要作用。同时,它具有真核生物基因表达时所需的基本功能,例如,启动作用、起始作用和转录物的多聚腺嘌呤加尾作用等。LTR的DNA序列已经测定,不同种的病毒的LTR长度不同,变动范围在250~1 400 bp之间,LTR的长度变化主要取决于U3的长度,它的变动范围在170—1 260bp之间。在LTR的两端各有一个反向重复序列。所有LTR的两端都是以TG...CA和AC…GT为标志。在未整合进宿主细胞基因组中的LTR的两端还各有两个碱基对,即AATG…CATT和TTAC…GTAA,这两个碱基对在LTR整合进宿主细胞基因组时会丢失。LTR在U3区内有同TATAA框十分相似的序列。TATTA框是真核生物中使用RNA多聚酶Ⅱ < 1 > < 2 >
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