反转录病毒

Ⅱ的转录单位所特有的序列。真核类基因转录时大部分用RNA多聚酶Ⅱ，TATAA框就是这类酶的接触位点。所以LTR很可能利用宿主细胞的RNA多聚酶Ⅱ来启动基因的转录。LTR的R—U5分界线上游20bp处还有AAG TAAA序列，这是真核生物都有的腺嘌呤核苷酸聚合作用的信号。在U5区内，距离R区10~25 bp处有TTGT或类似序列，这是病毒RNA合成的终止信号，这对终止病毒RNA的合成可能起重要作用。在U3—R分界线处还常有一个反向重复序列，这对终止病毒RNA的合成可能也有重要作用。除此之外，左边LTR的U3区启动子负责启动前病毒的转录，右边LTR的U3区启动子有时能启动位于前病毒插入位点下游的宿主DNA序列的转录，不过这种情况很少发生。LTR中还有增强子序列，可以增强病毒RNA的转录能力，或对前病毒DNA两侧的宿主DNA的转录活性起调控作用。    LTR序列比较分析的结果表明，同种病毒株的LTR核苷酸序列相同或相似，不同种病毒的LTR序列可以各不相同。但各种病毒株的LTR都有同源的核苷酸序列。主要如上面提到的那些序列，这对完成病毒的生命周期是不可缺少的。当病毒DNA整合在生殖细胞的基因组中时，就成为宿主的“内源前病毒”而传给子代。一般情况下，内源前病毒是不表达的，除非有其他因子的作用才会被激活而表达，如感染了另一种病毒等。
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