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在于高等动物的唾液、肠液以至低等动物的消化液中。β-葡糖苷酶，存在于高等动物的小肠液中。β-半乳糖苷酶（乳糖酶）存在于高等动物的肠液及低等动物的消化液中。淀粉酶，广泛存在于高等动物的唾液、胰液和低等动物的消化液中。高等动物唾液中的淀粉酶，特称为唾液淀粉酶。纤维素酶存在于低等动物的消化液中，木蠹蛾的唾液中，凿船贝的中肠细胞（细胞内消化）、某种木材穿孔昆虫幼虫的肠液及其他部位，此外，在高等动物（也包括某种低等动物）消化道内的寄生生物（细菌、原生动物等）也有分泌。木质素酶和几丁质酶存在于蜗牛的中肠腺分泌液（胃液）中。菊粉酶（inulase）存在于蜗牛的中肠分泌液以及牡蛎的消化盲囊的细胞内（细胞内消化）。木聚糖酶，存在于羊、马等的肠液以至蜗牛、属（Cellana）鲍鱼等的中肠腺中，前者是否是出于寄生细菌尚不清楚，后者是否直接参于细胞内消化也不明瞭。精氨酸酶存在于食昆布科植物的 Calotomusjaponicus、鲍鱼、荣螺等的消化液中。（ 3）脂肪分解酶：脂酶，存在于高等动物的胰液中，此外还存在于胃、中肠腺以及低等动物的变形细胞（消化合体细胞digestive syncytium）中。（4）核糖核酸酶，去氧核糖核酸酶在高等动物的胰液中发现。核苷酶，发现存在于高等动物的肠液中。
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