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出天花病毒，结果显示，若干学生成为受害者。经10天潜伏期后，波特兰市各医院开始报告病历，史密斯的计算机模拟记述可能发生的破坏是：第一天有1281人被传染，零死亡率；第35天，有23919人被传染，551人死亡；第70天，有380582人被传染，12499人死亡。史密斯想要知道，如果地方政府关闭了学校结果将会如何？如果他们大规模接种疫苗结果将如何？如果政府让整个城市与外界隔离结果又将如何？于是，史密斯为一组计算机编制了程序，模拟上述一些假设，试图测定哪一种反应可以挽救更多的生命。结果他得出了多项发现。其一，空中运输可能是疾病蔓延的最大因素；而关闭学校并不像所预期的那样特别有用，因为父母可能会将孩子从学校接走，带他们去购物中心或游乐场，在那里与被感染的人接触。史密斯的模型也证明，政府介入的速度比介入的方式更重要。他发现，如果政府在10天或更长时间后介入，则会使更多的人死亡。
计算机模型研究人员面临的最大挑战是：在实际恐怖攻击发生之前，他们不可能知道这些模型的准确度。唯一得到了验证的系统，是弗南德兹的飓风如何影响电网的预测模型。
2004年9月，弗南德兹研究小组采用这一系统，来预测“弗朗西丝”飓风的路线。他建议佛罗里达州政府，将紧急抢修小分队安置在他认为该州受灾最严重的某些地方，后来证明，他的建议是正确的。他的计算模拟结果也提出，要花11天才能使该州的电力恢复到90%的供电水平，最后结果与真实情况完全一样。他估测的飓风损失为280亿美元，而最终总损失为270亿美元。但弗南德兹说，他对“弗朗西丝”飓风的准确预测还仅仅是初步的，因为世界太复杂了，以至于不可能在计算机模型中考虑到每一种特殊情况。
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