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新体系基本完善，自主创新能力明显提高；海洋科技对海洋经济、海洋管理、减灾防灾和海洋安全的支撑能力显著增强；海洋科技对海洋经济的贡献率达到50%；海洋科技资源配置得到优化，海洋科技高层次人才数量增加30%，海洋科技成为支撑和引领海洋事业发展的重要力量。到2020年，海洋科技总体水平达到中等发达国家同期水平，为建设海洋强国奠定坚实的科技基础。
为确保规划目标的实现，推动我国海洋科技全面快速发展，《规划纲要》统筹考虑并明确提出了“十一五”期间，我国海洋科技发展的八大重点任务。一是发展海洋监测预报技术，提高海洋环境保障能力；二是发展海洋开发保护技术，推动海洋经济健康发展；三是开展海洋科学研究，提高海洋规律认知水平；四是开展海洋管理研究，促进海洋事业可持续发展；五是实施海洋重大专项，满足国家重大战略需求；六是推进海洋创新体系建设，提高海洋科技创新能力；七是加强海洋科技平台建设，提高海洋科技基础能力；八是加强海洋科技教育，培育海洋科技人才队伍。
此外，《规划纲要》还从加强全国海洋科技的组织领导与统筹协调，加大海洋科技投入，深化海洋科技体制改革，扩大海洋科技国际合作，营造科技成果转化和产业化环境，提高全民族海洋意识等方面提出了多项保障措施，以保证《规划纲要》的贯彻落实。
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