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尽管爱因斯坦本人对量子理论做出了巨大贡献，但是他认为量子理论是不完善的。爱因斯坦不喜欢量子理论中违背直觉的内容——例如量子的不确定性，他说：“上帝不是在抛硬币。”爱因斯坦认为事物的背后隐藏着更为深刻的本质，而量子理论是无法揭示的。波尔则不同意爱因斯坦的观点，“上帝不仅是在抛硬币，而且会把硬币抛到我们看不到的地方。”波尔说。从80年代开始，大多数物理学家都认为波尔是正确的。
据《自然》杂志最近报道，现在卡尔-赫斯和沃尔特-菲力浦提供了有力的证据证明爱因斯坦的怀疑是正确的——在量子理论背后的确有另一套规律在起作用。
在1935年，爱因斯坦与另外两个物理学家一起做了一个“思想实验”，通过这次试验他们发现，根据量子理论可以推导出一种奇怪的长距离作用——对于一个粒子的测量会影响到另外一个粒子，不论它们的距离有多远。由于这一奇怪的现象，爱因斯坦认为有更为基本的理论隐藏于量子力学背后。他提出了“隐藏变量”——那些可以改变量子的不确定性的量，但是这些量是不能被直接测量的。
科学家现在发现，如果“隐藏变量”有随时间变化的性质而且相互关联，爱因斯坦的怀疑就是正确的。例如，伦敦的钟表和纽约的钟表会同时旋转，但并不相互影响。但是它们所显示的时间确实是相互关联的。
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