178个与人有关细菌基因组测序完成 |
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来源:《科学》 更新时间:2010-7-15 10:57:49 |
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16S rDNA序列的系统进化树,来源:《科学》/美国科学促进会
在5月21日出版的Science杂志上,美国国立卫生研究院人类微生物旗下的学术联盟(Human Microbiome Jumpstart Reference Strains Consortium)的研究人员公布了微生物基因组测序计划中的前178个与人类宿主有关的细菌基因组序列的最初的分析。
研究人员将与其他人共享他们的数据,这样其他的遗传学家如果试图从自然环境中对大量的微生物基因组做直接采样的话,他们可以参考这些数据。这一对我们身体上的微生物的更好的理解会在将来为了解某些人类的疾病提供线索。
由于二十世纪90年代启动的人类基因组计划(HGP)以当时的技术水平要在15年内完成这一计划任务是很艰巨的。为了顺利完成人类基因组特别是功能基因组计划,科学家们同时也启动了模式生物基因组计划,以期探讨序列测定的新技术新方法以及确定基因功能的表达模式,其中包括大肠埃希菌、流感嗜血杆菌、酿酒酵母等微生物。
在过去的10年中,微生物学领域得到巨大的转变,这部分是由于坐落在马里兰州洛克菲勒市的基因组研究所(TIGR)的基因组测序仪的帮助。TIGR的科学家们发表了最初三个完整的微生物基因组序列——Haemppholus influenzae, Mycoplasma genitalium与Methanococcus jannaschii,并且随后完成了至2004年1月份全球完成与发表的150个微生物基因组中的40个。
在这篇文章中,研究人员研发了对在其自然环境中的微生物进行大规模基因组测序的标准化方法,他们的目标之一是为至少900种将人体称为住所的细菌制作出参照基因组序列。目前公开的是头178个与人类宿主有关的细菌基因组序列的最初的分析。 到目前为止,这些结果给未来的分析工作提供了一个重要的基线,尽管这些研究人员说,他们只是刚刚触及了人类“微生物组”的表面而已。
2007年Science杂志就预测,人体微生物的研究可能成为国际科学家们的新热点课题,时间过去3年,这一预测就得到实现,随着肠道微生物基因组计划,肠道微生物与代谢疾病的研究步伐的加速,肠道微生物研究受到空前的重视。
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