178个与人有关细菌基因组测序完成 |
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来源:《科学》 更新时间:2010-7-15 10:57:49 |
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在今年三月,Nature杂志就以封面文章的形式公布了人体肠道元基因组研究计划(MetaHIT)的一部分,研究人员用高通量的测序技术和高效能的信息分析平台,取得了一系列突破性的研究成果。
机体除受自身基因的调控外,还受到大量的共生细菌的影响。这些细菌大部分寄生在人的肠道中,通称为肠道菌群,在学术界常被称作“人体肠道元基因组”。该项研究成果收集了124个来自于欧洲人肠道菌群的样本,采用了新一代大规模高通量的测序技术进行深度测序,产出近6千亿的碱基序列。经过序列组装和基因注释分析,从中获得330万个非冗余的人体肠道元基因组的参考基因,约是人自身基因的150倍。这个基因集中包含了绝大部分目前已知的人体肠道微生物基因,但更多的是目前未知微生物的基因。从这个基因集中可以估计人肠道中存在约1000到1150种细菌,平均每个体内约含有160种优势菌种,并且这些细菌是绝大部分个体所共有的。(来源:生物通 万纹)
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