鞘氨醇单胞菌KC8全基因组测序完成

来自中科院城市环境研究所城市环境与健康重点实验室，环境生物技术课题组的研究人员完成鞘氨醇单胞菌KC8（Sphingomonas strain KC8）全基因组测序，是国际上第一例雌激素降解菌的全基因组序列测定。这一研究成果在线公布在《细菌学期刊》（Journal of Bacteriology）上。文章的通讯作者是环境生物技术课题组于昌平博士，第一作者是助理研究员胡安谊博士，这项工作得到中国科学院、科技部和厦门市资助。其中于昌平博士曾在德州农工(A&M)大学从事博士后研究工作，2009年入选中国科学院“百人计划”。主要研究方向是环境生物技术，新兴污染物去除，厌氧发酵产氢等。雌激素是一类重要的环境内分泌干扰物（endocrine-disrupting compounds），由于环境雌激素对野生动物及人类健康有着潜在危害，研究雌激素在环境中迁移转化及降解具有重要意义。长期研究表明，微生物降解途径是去除环境中雌激素活性的主要方式。虽然目前已陆续有雌激素降解菌被分离培养，然而有关雌激素的微生物降解机制尤其是基因层次方面尚不清楚。鞘氨醇单胞菌KC8基因组测序的完成将为后续的功能基因分析提供重要依据。在这篇文章中，研究人员完成鞘氨醇单胞菌KC8（Sphingomonas strain KC8）全基因组测序，是国际上第一例雌激素降解菌的全基因组序列测定。除此之外，近期还完成了一些值得关注的物质基因组测序，比如一种致病的真菌：茎基溃疡病菌(Leptosphaeria maculans) ，这种真菌能导致十字花科蔬菜，如椰菜，卷心菜和小白菜(bok choy)，发生茎溃疡(stem canker)，也是油菜(oilseed rape)的一个主要的威胁，其中油菜可以用来生产菜籽油(canola oil)，动物饲料和生物燃料。另外研究人员还完成了一种金藻(golden alga)：褐潮藻(Aureococcus anophagefferens) 的基因组测定，这种藻类能导致威胁渔业和沿海海洋生物生存的褐潮(brown tide)形成，它的基因组要比其他的光合作用藻类大，有更多的基因用于光捕捉，有机碳和氮利用以及抗菌剂的合成，从而潜在性地允许它在繁盛期间接管整片海域。（来源：生物通万纹）