肺癌分子检测可预测患者生存概率 |
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来源:《柳叶刀》 更新时间:2012-1-30 10:21:54 |
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南。
分子检测如何预测肺癌患者的生存率
该分子检测是以加州大学旧金山分校最初开发的技术为基础,由一家总部位于加州山景城(Mountain View)的Pinpoint Genomics公司研制成功的。其技术平台采用的是一种称为定量聚合酶链式反应 (qPCR)的标准实验室技术。
分析程序是从一块石蜡包埋的病人癌组织样本开始的 — 石蜡包埋是保存手术切下来的所有组织样本的标准方法。一种叫做RNA的材料(可以显示基因在组织中的相对活性水平)从肿瘤组织中被提取出来。然后确定14个特异基因的活性水平并与正常肺组织中的水平相比。这组基因中的11个基因是与肺肿瘤生物学有关的,而其他三个基因是用来标准化这些癌症基因检测的常见基因。
Pinpoint Genomics公司在分析了加州大学旧金山分校医学中心的361例肺癌组织样本后,开发出一个计算死亡风险的算法,而这些病人都是一种常见的称为非鳞状非小细胞肺癌的患者并接受了手术治疗的。该算法把这14个基因的活性水平与这些病人的临床结果对应起来,其理论依据是:一个患者的与死亡风险程度低、中、或高相关的分子图谱可以用来预测另一个患者的死亡风险。
为了确认他们的算法,加州大学旧金山分校研究组与加州凯撒医疗中心奥克兰研究所合作,采用盲测的方法分析了另外433例来自北加州的患有最早期同类型肺癌的病人肿瘤样本。他们还用类似的盲测法分析了1,006例中国肺癌患者的组织样本来进一步测试其算法。而在中国,肺癌是导致死亡的主要因素之一。研究组指出 – 迄今尚没有其他测试分子预后指标的临床试验可以展示在两个不同大陆的不同遗传种群中能取得相同的结果。
科学家们发现,在这些更大组群的患者中,甚至包括二期和三期的肺癌患者,该算法都能够非常准确地区分出死亡风险的高、中、低程度。(来源:美国科学促进会)
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